"...Есть необходимость в кодирования двух и более потоков. Нужно ли для каждого потока приобретать лицензию для энкодера?..."Необходимость дополнительной лицензии зависит от той задачи, которую вы решаете.
Например, с одного сервера вы хотите вещать два разных телеканала. В этом случае нужно приобретать две полноценные лицензии, не только для энкодера.
Другой случай - вещание своего канала в HLS. В этом случае, как правило, формируются несколько потоков с разным битрейтом и размером кадра (это называется "адаптивный стриминг") в сжатии AVC. Для такого вещания дополнительные лицензии не нужны - картинка по факту одна, но с разными параметрами потока.
Ещё вариант - разные провайдеры просят поток с одним и тем же типом сжатия, например, AVC. Но при этом битрейт у потоков должен быть разный. Для такого вещания дополнительные лицензии тоже не нужны. Ситуация аналогичная - картинка по факту у вас одна, но с разными параметрами потока.